Храм Спаса Всемилостивого был построен в 1716–1723 годах. На месте храма до 1612 года находился Андреевский мужской монастырь. На территории монастыря располагалось два храма: церковь Святого Апостола Андрея и церковь Происхождения Честного Креста Господня с приделом Сретения Иисуса Христа, а также 12 монашеских келий. В 1612 году монастырь «сожгли литовские люди», уничтожили литовские отряды. Ко второй половине XVII века был построен новый храм во имя «Происхождения честнаго и животворящего Креста Господня». Церковь была деревянной, шатровой, с трапезной и папертью, покрыта тесом — деревянными досками особой формы. На колокольне находилось 6 колоколов общим весом 20 пудов или 330 килограммов, а также часы. Церковь была построена на деньги прихожан. Известно имя первого священника — его звали Алексей Садофов. Приход в 1693 году насчитывал 41 человек.
В народе церковь Спаса Всемилостивого называли «Спасом под горою». После постройки Белозерского обводного канала в 1846 году он получил неофициальное название, под которым наиболее известен и сейчас — «Спас на канале».
В 1753 году после сильного пожара был полностью утрачен первоначальный интерьер храма. Храм был восстановлен в 1755 году.
Колокольня являлась своеобразным маяком для рыболовецких и торговых судов. И колокольню и главки венчали кованые ажурные кресты. На нижней перекладине креста, выполненной в форме полумесяца рожками вверх, можно было рассмотреть год установки центрального креста — 1783.
Главок у церкви пять, они венчают четырехскатную крышу. Только центральный барабан — световой, с окнами, остальные — ложные, глухие. Верхнюю часть храма украшают особые архитектурные элементы — кокошники, они расположены в шахматном порядке, а также двойной пояс из изразцов, сделанных, возможно, в Великом Устюге. Низкий алтарь с высокой кровлей колоколообразной формы в стиле барокко увенчан маленькой главкой.
В интерьере храма сохранились остатки живописи с пышной лепниной в стиле барокко.
В 1930-е годы храм был закрыт. Здание использовалось под мастерские, пекарню, спортзал, затем было передано в ведение музея. С 1970-х годов начались реставрационные работы. С 1988 года по начало 1990-х группа московских инженеров под руководством Константина Козлова соорудила особую систему, которая отводит грунтовые воды от фундамента. В 2011–2012 годах ко дню города Белозерска церковь Спаса Всемилостивого полностью отреставрировали.
В народе церковь Спаса Всемилостивого называли «Спасом под горою». После постройки Белозерского обводного канала в 1846 году он получил неофициальное название, под которым наиболее известен и сейчас — «Спас на канале».
В 1753 году после сильного пожара был полностью утрачен первоначальный интерьер храма. Храм был восстановлен в 1755 году.
Колокольня являлась своеобразным маяком для рыболовецких и торговых судов. И колокольню и главки венчали кованые ажурные кресты. На нижней перекладине креста, выполненной в форме полумесяца рожками вверх, можно было рассмотреть год установки центрального креста — 1783.
Главок у церкви пять, они венчают четырехскатную крышу. Только центральный барабан — световой, с окнами, остальные — ложные, глухие. Верхнюю часть храма украшают особые архитектурные элементы — кокошники, они расположены в шахматном порядке, а также двойной пояс из изразцов, сделанных, возможно, в Великом Устюге. Низкий алтарь с высокой кровлей колоколообразной формы в стиле барокко увенчан маленькой главкой.
В интерьере храма сохранились остатки живописи с пышной лепниной в стиле барокко.
В 1930-е годы храм был закрыт. Здание использовалось под мастерские, пекарню, спортзал, затем было передано в ведение музея. С 1970-х годов начались реставрационные работы. С 1988 года по начало 1990-х группа московских инженеров под руководством Константина Козлова соорудила особую систему, которая отводит грунтовые воды от фундамента. В 2011–2012 годах ко дню города Белозерска церковь Спаса Всемилостивого полностью отреставрировали.