В 1548 году по настоянию братии и благословению архиепископа Новгородского Феодосия настоятелем Соловецкого монастыря стал Филипп (в миру Феодор) Колычёв, позднее канонизированный.

Выходец из знатного боярского рода, Феодор с ранних лет тяготел к иноческим подвигам. Оставив жизнь при дворе Иоанна IV, он тайно ушел на Соловецкие острова, где через полтора года принял постриг под именем Филиппа. Инок исполнял тяжелые послушания, жил уединенно, снискал уважение братии и спустя девять лет принял игуменский сан.

При Филиппе обитель процветала. Ее благотворителями были многие влиятельные люди, включая царя Иоанна Грозного, в то время благоволившего игумену; в частности, монахи получили право беспошлинно торговать солью, которую сами и варили. В короткие сроки монастырь стал крупнейшим культурным и промышленным центром северного Поморья. Соловецкие острова всегда указывали на картах и западноевропейские картографы.

В этот период в монастыре воздвигли новые храмы Преображения Господня (там поместили мощи святых Савватия и Зосимы) и Успения Богородицы. Были обретены образ Богоматери Одигитрии, принесенный преподобным Савватием, и каменный крест, стоявший перед кельей святого; Псалтырь и ризы святого Зосимы.

Первооснователи Соловецкие Зосима и Савватий известны как чудотворцы — защитники мореплавателей и целители. Их общецерковное почитание утверждено в 1547 году; несколько позже был канонизирован и Герман Соловецкий, сподвижник обоих святых.

Первая, не сохранившаяся редакция жития Савватия и Зосимы появилась в конце XV века. Вторую записал со слов старца Германа ученик Зосимы Досифей, но пропала и она. Досифей же, по воспоминаниям Германа и собственным, составил третье житие, которое, в редакции инока Феропонтова монастыря Спиридона-Саввы, сохранилось в единственном списке. Следующая редакция принадлежала Максиму Греку; со временем она была дополнена рассказами о чудесах и Похвальным словом.

Известно несколько изводов с изображением святых Зосимы и Савватия. На представленной иконе у ног первооснователей Соловецких расположен весь монастырь, показанный с высоты птичьего полета. Черты прямой перспективы позволили иконописцу создать достаточно подробную карту обители не только с храмами, но и с бытовыми постройками, рыбными амбарами, подплывающим к берегу карбасом, даже птицами на дворе. В качестве образца мастер использовал икону, ныне хранящуюся в коллекции Вологодского музея.