В 1571 году по указу Ивана Грозного была создана система сторожевой и станичной службы. На пограничных районах организовали сторожи — наблюдательные пункты с небольшим отрядом (станицей). В его задачи входила разведка, выявление неприятельского войска и направления его следования. Со временем граница Московского государства отодвигалась всё дальше на юг, а патрулирование территории на дальних подступах позволяло детально изучить топографию местности.
По современной территории Белгородчины проходили три основные дороги, по которым совершались набеги на южные границы Московского государства — Муравский, Изюмский и Кальмиусский шляхи.
Решение о строительстве города Белгорода было принято Боярской думой в 1593 году. Осенью 1596 года по указу царя Фёдора Иоанновича (1584-1598) была сооружена крепость на высоком холме на правом берегу Северского Донца при впадении в него ручья Ячнев Колодезь. В декабре 1612 года Белгород был захвачен и сожжён отрядом черкас. Через несколько лет город был полностью отстроен на другом (левом) берегу реки Северский Донец.