Окончив в 1900 году Казанский университет, откуда он вышел «со степенью лекаря», Б.Л. Хлебников, согласно семейному преданию, далее учился в Германии, в Геттингенском университете. В военное время был дважды мобилизован: в русско-японскую войну служил на Дальнем Востоке, а во время Первой мировой войны оказался в немецком плену. По возвращении в Астрахань  работал по специальности, имел частную практику на дому. Во время эпидемии самоотверженно работал в холерных бараках. Известен как создатель астраханского венерологического диспансера.

Похоронен в Астрахани, на старом русском кладбище, в фамильной усыпальнице Хлебниковых. Фотография двоюродного брата поэта по линии отца (1867–1937) из фамильного фотоальбома Хлебниковых. Этот альбом, в кожаном переплёте с металлической застёжкой, частично утраченной, содержит 87 фотографий семьи Хлебниковых, их родственников и знакомых. Он состоит из 46 страниц и титульного листа с цветным орнаментом. Кроме 87 фотографий,  большинство которых выполнено в Казани, Симбирске, Астрахани, Санкт-Петербурге, Москве, Царицыне, где проживали родители поэта или его родственники, альбом содержит 42 открытки, в основном с портретами русских и зарубежных писателей-классиков: Пушкина, Лермонтова, Гоголя, Достоевского, Тургенева, Салтыкова-Щедрина, Некрасова, Байрона, Гёте, Гейне.

Сохранность альбома не удовлетворительна, переплёт расшатан, кожа на нём заметно истёрлась, многие ячейки для фотографий — с надрывами. Всюду — пятна, почернения листов. Некоторые ячейки пустуют. За долгие годы альбом прошёл через множество рук, и теперь трудно сказать, были ли они заполнены фотографиями. Трудно ручаться и за точный порядок самих фотографий. Их опись сделана по состоянию альбома на декабрь 1994 года, когда он был передан в музей.