Свою книгу «Сибирь как колония» он посвятил русской колонизации Сибири. В ней он детально описал все сферы жизни обширной страны и их особенности. Автор в своих рассуждениях о перспективах и успехе колонизации стоял на расовых и националистических позициях, что было характерно для идеологии того времени. Книга богата ценной информацией по истории, географии, экономике, демографии, этнографии Сибири. Ядринцев писал об особенностях характера сибиряков, отмечал такие черты, как индивидуализм, ориентацию на промышленный характер деятельности, стремление к новизне, любознательность, тягу к воле, простору и равенству. Он утверждал, что сибирский русский крестьянин выше по развитию и привычкам своего европейского собрата.

Ядринцев рассматривал проблемы взаимоотношения колонизаторов и коренных народов, заселения Сибири преступниками и каторжанами. Он писал об эксплуатации сибирской природы, об экономике края, о недостатке учебных заведений, о пробуждающемся в сибиряках стремлении к образованию. По его мнению, несметные богатства Сибири, её необжитые просторы должны, в первую очередь, служить на её благо.

Из книги «Сибирь как колония»: «В интересах человечества, как и в интересах русской народности, наступает время призвать наши окраины к новой жизни, пробудить их общественные силы к самодеятельности, и тем положить начало новому историческому периоду. Признание совершеннолетия общества, дарование ему гражданских прав, удовлетворение общечеловеческих стремлений есть священнейший долг метрополии по отношению ко всякой молодой развивающейся в её руках стране».