В тот период Патриарх обладал примерно тем же авторитетом и властью, что и сам Пётр. Кроме того, у Церкви были накоплены большие богатства, которые пригодились бы царю в войне со шведами. Однако всё это мешало ему использовать все возможные ресурсы ради достижения победы. Поэтому перед Петром стояли задачи уничтожить административную и экономическую автономии Церкви, снизить численность духовенства и, в целом, встроить институт церкви в аппарат государства.
25 января 1721 года патриаршество было окончательно упразднено. В результате реформы была ликвидирована должность Патриарха; финансовая и административная автономии церкви были утрачены; количество духовенства было снижено, а налоги увеличены; стали проводиться рекрутские наборы из церковных крестьян.