В минералогической коллекции Муниципального музейно-выставочного центра г. Дальнегорска в разделе «Палеонтология» хранится образец окаменелого дерева, который был найден в Надеждинском районе Приморского края. За несколько миллионов лет слои древесины заместились кварцем и окаменели. Дерево приобрело вид агата, оникса с концентрически-зональной структурой, окрашено в коричневый цвет разных оттенков.

Процесс окаменения происходит под землёй, когда дерево оказывается «похороненным» под осадком и не портится из-за недостатка кислорода. Богатая минеральными веществами вода, текущая сквозь осадок, приносит минералы в клетки растения, лигнин и целлюлоза распадаются и замещаются минералами (зачастую силикатами, такими как кварц). При этом микроскопическая структура дерева сохраняется. Часто окаменелые деревья встречаются в вулканических областях, в которых происходили извержения вулканов в лесных ареалах.