Крест «За заслуги перед казачеством» предназначен для поощрения воинских соединений и частей, морских судов, пограничных застав, носящих наименование казачьих, за образцовые показатели в несении службы в мирное время и за героизм и мужество, проявленные во время выполнения задач в боевых условиях. Также Крестом «За заслуги перед казачеством России» награждаются ветераны ВОВ, участники боевых действий, казаки, находящиеся на военной и иной госслужбе за усердие, отличие и инициативу, проявленные во время выполнения поставленных задач и особый вклад в становление и развитие казачество и за укрепление и защиту государства.
Атаманы отдельских, окружных, войсковых и прочих казачьих обществ представляются к Кресту «За заслуги перед казачеством России» за умелое руководство, а казаки-деятели науки и культуры — за значительный вклад в возрождение казачества. Награды могут быть удостоены и иные граждане, внесшие значительный вклад в дело становления казачества. Правом представления к Кресту «За заслуги перед казачеством» 3 степени наделен Совет атаманов войскового казачьего общества.