В годы Великой Отечественной войны в Свердловск были эвакуированы учреждения Академии наук СССР. Местом их размещения стали Уральский филиал АН и Уральская комплексная экспедиция. Летом 1941 года в Свердловск были эвакуированы Институт металлургии, лаборатории кристаллографии, рентгено-химического и спектрального анализа Института геологических наук АН СССР. Осенью на базе свердловского филиала разместились лаборатории Харьковского института черной металлургии АН УССР, Институт горного дела. Кроме того, в столицу Урала перебазировались оборонные департаменты Отделения геолого-географических наук: комиссия аэрофотосъемки, комиссия по стратегическому сырью, комиссия по составлению военно-географических очерков, комиссия по редким металлам и пещерная комиссия.

В годы войны в городе работал Президиум Академии наук СССР, Совет филиалов и баз Академии, Совет Академии по научно-технической пропаганде, Отделение истории и философии, Группа по истории техники при Отделении технических наук, Свердловское отделение издательства Академии, сейсмическая станция Сейсмологического института Академии и др.

 
В начале мая 1942 года в Свердловске прошло общее собрание Академии наук СССР. В его работе приняли участие 69 академиков и 40 членов-корреспондентов, прибывших в областную столицу из различных регионов страны. В рамках собрания было принято решение о переизбрании президента и шести вице-президентов. Ими стали академики Бардин, Байков, Богомолец, Волгин, Иоффе и Орбели.

 
Основной вопрос повестки был, тем не менее, в том, чтобы подчинить текущую работу Академии наук практическим нуждам военного производства и сосредоточиться на открытиях оборонного значения. Для этого были созданы военно-морская и военно-санитарная комиссии, которые должны были оказывать консультативную помощь Красной армии в вопросах навигации, авиастроения, стратегии и тактики военных операций и так далее.