История музея началась в 1929 году с создания Окружного бюро краеведения. Его приоритетом было изучение языка, культуры и быта ненцев. Сразу начали пополняться фонды будущего музея, а спустя три года состоялась первая выставка. В 1934 году Ненецкий краеведческий музей открылся в Доме Ненца, в городе Нарьян-Мар.
Археологические экспедиции, формирование новых коллекций и архивов, научная деятельность и дипломы Министерства культуры привели к тому, что музей стал научным центром края.
Сейчас в фондах Ненецкого краеведческого музея хранится более 40 тысяч предметов: этнографические коллекции ненецкого, коми, русского населения, художественные собрания, фото- и документальные материалы, предметы языческого культа. Интересны коллекции старопечатной книги, геологии и археологии. В музее есть и палеонтологические экспонаты, среди которых — череп мамонта, кости трогонтериевого слона, отпечатки древних растений.
