Судакская крепость — один из первых государственных историко-архитектурных заповедников на территории Российской империи, возникший в 1868 году.
После революции 1917 года и Гражданской войны здесь был открыт историко-археологический музей, а в 1920 годах начались историко-археологические исследования.
С 1958 года Судакская крепость перешла в ведение Государственного архитектурно-исторического заповедника «Софийский музей» при Академии строительства и архитектуры УССР.
1 августа 2014 года на базе музея было создано ГБУ Республики Крым «Музей-заповедник „Судакская крепость“», подведомственное Министерству культуры РК. С начала 2015 года в состав музея был включен исторический музей (бывший особняк Функа), где расположилась экспозиция Судакского исторического музея.
С 1960-х годов Судакская крепость функционирует как мощный музейный комплекс и признанный объект познавательного туризма. В последние несколько десятилетий его ежегодно посещает более 200 тысяч туристов.
