Возникшим в ходе нефтегазового освоения северным городам Ямало-Ненецкого автономного округа до поры до времени было не до музейного строительства. У первопроходцев имелись свои великие задачи. Когда комсомольцы постепенно стали перебираться из брезентовых палаток и балков в благоустроенные дома, появилась надежда на приобщение к культурным ценностям. Шефство над молодыми северными городами взяло Управление культуры Тюменского облисполкома. 29 апреля 1988 года был учрежден Надымский филиал Тюменского музея изобразительных искусств, что позволило переместить часть художественного фонда из Тюмени на север области. Так началось комплектование фондов надымского музея.
Формирование коллекции «Археология» было положено раскопками Надымского городища, начатыми в 1998 году по инициативе историка В. Н. Гриценко. Сегодня комплексное изучение памятника осуществляется ООО «Научно-производственным объединением «Северная археология-1» (г. Нефтеюганск) под руководством О.В. Кардаша. Переданные в музей артефакты вдохновили сотрудников на создание экспозиции исторического профиля. Способствовало этому и преобразование в 1999 году местного филиала Тюменского музея в самостоятельный Музейно-выставочный центр, который 28 ноября 2001 г. был преобразован в Муниципальное учреждение культуры «Музей истории и археологии г. Надыма».
