Официальная дата учреждения музея — 1921 год. Антон Павлович Чехов завещал ялтинский дом, в котором он прожил последние пять лет своей жизни, сестре в пожизненное пользование. Также он завещал ей деньги и доход от посмертных публикаций его драматических произведений.
Мария Павловна Чехова после смерти брата содержала этот дом, сохранив и упорядочив архив писателя. С 1917 года она поселилась в ялтинском доме вместе с матерью на постоянное проживание. До своей кончины 15 января 1953 года она сохраняла дом в целости и сохранности. Смогла восстановить его после Крымского землетрясения 1927 года, уберечь во время фашистской оккупации в 1944 году. Благодаря Марии Павловне из мемориального дома не пропало ни одного экспоната.
Мария Павловна Чехова после смерти брата содержала этот дом, сохранив и упорядочив архив писателя. С 1917 года она поселилась в ялтинском доме вместе с матерью на постоянное проживание. До своей кончины 15 января 1953 года она сохраняла дом в целости и сохранности. Смогла восстановить его после Крымского землетрясения 1927 года, уберечь во время фашистской оккупации в 1944 году. Благодаря Марии Павловне из мемориального дома не пропало ни одного экспоната.
Сейчас Дом-музей А. П. Чехова в Ялте является отделом ГБУК РК «Крымский литературно-художественный мемориальный музей-заповедник» — подведомственное учреждение Министерства культуры Республики Крым. В состав музея-заповедника также входят: Дача А. П. Чехова и О. Л. Книппер в Гурзуфе, отдел «Чехов и Крым» на даче Омюр, Музей А. С. Пушкина в Гурзуфе.