В естественно-научном разделе собрания представлены различные по весу, цветовой гамме, степени прозрачности образцы янтаря. В экспозиции находится самый крупный в России «солнечный камень»: его вес — 4 кг 280 г. Значительную часть коллекции составляют образцы янтаря с включениями остатков животных и растительных организмов, попавших десятки миллионов лет назад в некогда жидкую и вязкую смолу.
Музей янтаря хранит артефакты, обнаруженные на территории Калининградской области при раскопках памятников II–V вв. н. э.
В культурно-историческом разделе собраны украшения и предметы быта из янтаря от эпохи неолита (IV–II тыс. до н. э.) до наших дней.
Музей янтаря хранит артефакты, обнаруженные на территории Калининградской области при раскопках памятников II–V вв. н. э.