Меншиков сопровождал царя в Азовских походах и в Великом посольстве. В списке волонтеров, отправляющихся в Европу для изучения корабельного дела, его имя стояло первым в группе, которую возглавлял сам Петр. Вместе с государем Меншиков работал на верфях, получал диплом корабельного плотника, присутствовал на торжественных приемах, изучал артиллерию и фортификацию. Вернувшись в Россию, он принял участие в расследовании стрелецкого бунта и в казнях стрельцов.

 
В годы Северной войны Меншиков участвовал в штурмах Нотебурга, осаде Ниеншанца, абордажном бою в устье Невы. Он стал кавалером ордена Святого Андрея Первозванного, а после основания в 1703 году Санкт-Петербурга был назначен губернатором Петербургской губернии.

 
В Полтавской баталии Меншиков командовал сначала авангардом, затем левым флангом российских войск, и именно его действия привели к разгрому корпусов Шлиппенбаха и Рооса. За Полтавскую победу Меншиков получил чин генерал-фельдмаршала. К этому времени он был уже князем Священной Римской империи, князем Российского царства с титулом Светлости и одним из богатейших людей России.

 
Незадолго до смерти Петра Меншикова обвинили в казнокрадстве и злоупотреблении властью и лишили основных должностей — генерал-губернатора Санкт-Петербургской губернии и президента Военной коллегии. В 1714 году была создана следственная комиссия по его делу. Меншикову удалось избежать серьезного наказания: он лишь оплатил несколько крупных штрафов. Прусский посол Аксель Мардефельд писал: