Мина ПМД-6 в базовой модификации получила простой деревянный корпус, состоявший из двух частей. Все основные детали боеприпаса помещались в небольшой вытянутый ящичек, который сверху накрывался крышкой. Крышка должна была выполнять функции датчика цели, для чего ее расположили на оси, расположенной в задней части мины. Важной особенностью конструкции корпуса была возможность изготовления всех деталей из имеющихся пиломатериалов. В зависимости от используемого сырья следовало незначительно изменять размеры некоторых деталей, но общие черты конструкции при этом оставались одинаковыми.

 
Нельзя не признать, что мина ПМД-6 имела весьма высокий модернизационный потенциал. Изначально простая конструкция позволяла использовать различные материалы и комплектующие. Как следствие, любой завод-изготовитель мог использовать имеющиеся в наличии ресурсы. Такая особенность мин привела к появлению изделий в деревянных и металлических корпусах. Благодаря стеклянному флакону были ликвидированы почти все ограничения по пригодным взрывчатым веществам.