Марфо-Мариинский женский монастырь в городе Белгороде был создан по уставу Марфо-Мариинской обители милосердия, которая была основана в Москве в 1909 году великой княгиней Елисаветой Феодоровной, прославленной Русской Православной Церковью в лике святых в конце XX века. Открытие в Белгороде Марфо-Мариинского женского монастыря благословлено Определением Священного Синода Русской Православной Церкви (выписка из журнала № 125) от 28 декабря 1999 года.
В состав монастыря входят два храма — Успенско-Николаевский собор и храм в честь Покрова Божией Матери. Успенско-Николаевский собор — памятник архитектуры начала XVIII века, а Покровский храм — памятник архитектуры конца XVIII века.
9 февраля 1994 года в одноэтажном здании, расположенном во дворе монастыря, была совершена первая Божественная Литургия. Почти два года (до восстановления и освящения Покровского храма) здесь совершались богослужения по воскресным и праздничным дням.
Монастырь по своему уставу общежительный. В настоящее время в обители живут 30 насельниц. Вся монастырская одежда и храмовое облачение изготавливаются ими. Сестры поддерживают чистоту и порядок не только в храме, но и в гостинице для паломников, готовят обед для работающих в монастыре строителей, благотворительно окормляют бедных людей и паломников.