Маршал Ланн, имевший не более 15 тысяч солдат, ясно видел уязвимость позиции Беннигсена. Он убедил Наполеона отправить к Фридланду корпуса маршалов Мортье, Нея, Виктора и императорскую гвардию. Через несколько часов численность французской армии достигла 80 тысяч солдат. Около часа дня к Фридланду прибыл и сам Наполеон. Концентрация сил Великой армии произошла незаметно для русских. К 5 часам вечера войска неприятеля изготовились и стремительно атаковали. Русская армия не была готова к сражению и не смогла отступить, сохраняя порядок. 

После нескольких часов битвы русские линии дрогнули и стали отступать под непрерывным огнём в упор французской артиллерии. После 8 часов вечера французы ворвались в горящий Фридланд. Отступление русских войск превратилось в беспорядочное бегство. Как записал в своём «подённом журнале» участник сражения офицер Императорского батальона милиции В. И. Григорьев: «Едва только некоторые успели перебежать по мосту через реку Аллер, как оный зажжён; оставшиеся же на той стороне переправились через отысканный по реке брод и защищались от нападавших холодным оружием и прикладами; ввечеру от всей нашей армии собрались только тысяч до тринадцати…; разложили огни, а пищи вовсе никакой не было…» Всего в сражении Российская армия потеряла (по неполным данным) около 15 тысяч человек, французы — около 12 тысяч. 

Наполеон одержал решительную победу. Через день, 16 июня русские войска ушли из Кёнигсберга, а 19 июня оставили всю Восточную Пруссию. Император Александр I вынужден был пойти на переговоры о мире с Наполеоном.