Нацистские ученые использовали узников концентрационных лагерей в качестве своих подопытных. Сохранилось множество сведений об экспериментах над людьми. Для большей части своих антинаучных изысканий немецкие «ученые и медики» находили оправдания. Часть из них была связана с сохранением здоровья немецких военных, другая — с расовой теорией.

Решением расовой «проблемы», которую видел нацистский режим, занимались многие теоретики и практики нацистов. Одну из самых своих жестоких форм эти «решения» приняли в концентрационных лагерях. От нацистского правительства имелся запрос на массовое истребление «неподходящих» людей, в документах это значилось как депортация или эвакуация. Основным средством истребления в концлагерях было вещество «Циклон Б».

После серии экспериментов над людьми его впервые применили в концлагере Освенцим в сентябре 1941 года. Для того чтобы использовать возможности узников по максимуму, вместо умерщвления в газовой камере в различных концлагерях проводились эксперименты по нахождению наиболее эффективного средства массовой стерилизации. Применялись методы хирургической и химической кастрации, рентгеновское облучение и кислотные инъекции в родовые пути.

Вопрос о нахождении наиболее эффективного способа истребления людей стоял до самого конца существования нацистского режима. Не обошли эксперименты стороной и детей. Йозеф Менгеле, которого называли Ангелом смерти, с особой тщательностью отбирал детей для своих экспериментов. Более всех его интересовали близнецы.

Часть опытов Менгеле и его коллег была связана с изучением глаз, в частности радужки. Предпринимались попытки найти способ смены цвета радужки глаза. Для этого закапывали кислотосодержащие препараты, проводили хирургические вмешательства, пересаживали радужку от одного узника другому и вкалывали химические реактивы в глаза. Способ изменить цвет радужки не был найден.

В набор офтальмологических инструментов из коллекции музея входит 21 предмет, включая футляр. Подобные наборы использовались также немецкими военными врачами и позволяли проводить практически все базовые оперативные вмешательства, которые могли понадобиться в условиях войны.