Обнаружение надгробия на территории города Липецка в 1974 году породило много вопросов и споров о расположении могилы Алексея Фёдоровича. По одной версии, прадед поэта был похоронен в слободе Липские железоделательные заводы (ныне город Липецк) в некрополе Пушкиных, который предположительно располагался при Вознесенском соборе.

Храм был построен еще в середине XVIII столетия, он украшал собой Вознесенскую площадь города (сейчас — Театральная площадь). До наших дней он не сохранился, в 1960-х годах его снесли. Согласно рассказам очевидцев, надгробие было привезено из центра Липецка вместе со строительным мусором и землей, как раз с места собора, что косвенным образом является подтверждением данной версии.

Согласно другому мнению историков, могила Алексея Фёдоровича Пушкина находится в селе Коренёвщино Добровского района Липецкой области, где располагалось родовое имение Пушкиных. Обычно помещиков после смерти хоронили на погосте около приходской церкви в их собственных поместьях. Вряд ли тело покойного перевозили из Коренёвщино в поселок мастеровых, каким тогда являлся город Липецк, в ноябрьскую распутицу за несколько десятков километров.

В пользу последней гипотезы также свидетельствует метрическая книга Покровской церкви села Коренёвщино за 1777 год, в которой как умерший был записан капитан Пушкин. Кроме того, останки детей, которые были похоронены задолго до смерти отца, наверняка не перевозили в слободу Липские железоделательные заводы. В настоящее время ни одна из версий не может быть полностью подтверждена или опровергнута.