Почетной награды Ушакова удостаивались моряки различных категорий и рангов Военно-морских сил за героизм, проявленный в сражениях или в мирное время. Первыми медаль получили моряки Черноморского флота: мичманы Степаненко и Горохов, старшина Щевбунов. В истории также зафиксированы случаи получения почетной награды матросами иностранных государств. Несколько раз медаль Ушакова вручалась повторно.

Вместе с медалью награжденные моряки получали специальный паспорт, в котором указывался ее серийный номер, отмечалось наличие других наград. Указанный документ служил основанием для получения денежного вознаграждения и льгот, а также подтверждал имя владельца медали. При утере оригинала дубликат награды выдавался только в особых случаях, когда доказывалась неизбежность утраты. Медаль могли выдать повторно при ее потере во время боевых действий или стихийного бедствия. Дубликат награды никак не штамповали или наносили на оборотную сторону букву «Д».

Медаль Ушакова не единственная государственная награда, носящая имя великих военачальников. В 1994 году были также утверждены медали Нестерова, Жукова и Суворова. Медаль Нестерова вручается военнослужащим военно-воздушных сил России. Медалью Жукова награждаются лица за заслуги в борьбе против фашизма. Медали Суворова удостаиваются герои, проявившие мужество при защите Родины.

Медаль Ушакова изготавливается из серебра, имеет форму круга диаметром 3,6 см. В центре размещен портрет великого адмирала Федора Федоровича Ушакова. Медаль соединяется с пятиугольной колодкой, которая покрыта светло-голубой лентой с васильковыми и белыми полосами по краям. Поверх ленты протянута стилизованная якорная цепь.

Сегодня медаль Ушакова входит в наградную систему Российской Федерации, она является одной из немногих наград, которые не претерпели изменений с момента создания.