В 1909 г. Михаил Алексеевич вернулся в Москву, и принял предложение работать в университетском институте судебной медицины. Он создавал серию муляжей научно-художественного характера. Учёные-естественники России и Западной Европы отмечали ценность коллекции научно-художественных скульптур по антропологии, зоологии, созданных Курбатовым для Дарвиновского музея и для музея Института судебной медицины Московского университета. 

В 1925 г. М.А. Курбатов по заданию института В. И. Ленина при ЦК РКП (б) сделал слепки с мозжечка и мозга В.И. Ленина. В 1935 г. он завершил работу над скульптурой В.И. Ленина (из цветной пластической массы), которая была установлена в музее Института Маркса-Энгельса-Ленина. М. А. Курбатов создал и уникальную галерею скульптурных портретов выдающихся людей — А.С. Пушкина, Л.Н. Толстого, Г.И. Успенского, И.И. Мечникова, О.Ю. Шмидта. Сходство удивительное, муляжи выглядят как живые. Известно, что дочь Толстого Мария Львовна, пораженная сходством скульптуры «Толстой изваянный» с живым отцом, на некоторое время даже потеряла дар речи и не могла двигаться. Секрет кроется в уникальном материале, который мастер использовал для своих работ. До сегодняшнего дня многие ученые изучают его состав и свойства. М.А. Курбатов не раскрыл секрет «волшебной массы». 

Михаил Алексеевич не раз навещал Белгород. Художник любил родной город, его тенистые скверы, часто выходил на природу, за город. Дом, в котором жил М.А. Курбатов со своей семьёй в Белгороде, находился на улице Красина, к сожалению, не сохранился. Но осталась серия картин «Белгородские мотивы» — о родине, с которой художник в душе никогда не расставался. Память об известном земляке хранит наш город. 4 октября 2006 года одной из улиц Белгорода было присвоено имя М.А. Курбатова.