После «литовского разорения» 1612 года Белгород восстанавливается под руководством воеводы Никиты Лихарёва на левом берегу Северского Донца — там, где сейчас находится район Старый город.

Строительство было завершено в 1613 г. При возведении крепости применялся испытанный принцип — максимальное использование особенностей местности для защиты населённого пункта. Город решено было поставить в низине, которая представляла собой некий полуостров. С одной стороны его огибала река Северский Донец, с другой — болотистая местность, и по сей день именуемая жителями Старого города Камышовкой. Сама же крепость располагалась на небольшой и относительно сухой возвышенности. Излишние паводковые и дождевые воды выводились через специальные водяные ворота. 

 В 1626 г. в Белгороде имелось: 12 храмов и 2 монастыря. Всего в крепости и посаде насчитывалось 833 двора, население составляло коло 5 тыс. человек. Существовала крепость до 1650 г.