Фауну Балтийского моря составляют виды, многие из которых встречаются и в соседних акваториях. Здесь обитают ушастые медузы, балтийская треска, из млекопитающих — обыкновенные и серые тюлени, кольчатые нерпы и морские свиньи. С Балтикой связаны многие особенности природы: в Калининграде на широте Новосибирска растут, цветут и плодоносят растения из субтропиков.
Балтийский серый тюлень и кольчатая нерпа являются самыми крупными морскими млекопитающими Балтийского моря. Тюлень распространен в акватории с Финским, Ботническим и Рижским заливами. Детеныши рождаются в конце февраля — начале марта. Для размножения серые тюлени используют припайные льды вдоль берегов.
Вес серого тюленя в Балтике достигает трех центнеров. В отличие от своего соседа — обыкновенного тюленя, — серый проводит у берегов только теплое время года, а на зиму уходит во льды открытого моря. Этот зверь способен нырять на 140 метров в глубину, легко оставаться под водой 20-30 минут. Питаются тюлени в основном рыбой и поедают до пяти килограммов в день. В их рацион входят тресковые, лососевые, камбалы, сельди, реже — крабы и мелкие кальмары. В пределах прибрежных вод Калининградской области встречи с тюленями редки.
Такие китообразные, как морские свиньи, в Балтийском море находятся под угрозой исчезновения. На территории Российской Федерации промышленный и прибрежный вылов морских свиней находится под запретом. В 1994 году вступило в действие Соглашение по сохранению малых китообразных Балтийского моря, Северо-Восточной Атлантики, Ирландского и Северного морей.
В наиболее холодных районах моря обитает балтийская кольчатая нерпа. Свое название она получила благодаря рисунку на шерсти, который состоит из большого количества светлых колец на темном фоне. Это самый крупный подвид кольчатой нерпы. Они не образуют колоний, а живут поодиночке. Иногда их можно увидеть в небольших группах, не связанных особо прочными узами. Они хорошо приспособлены к круглогодичному пребыванию в море.
