В фондах музея хранятся ценные нотные и литературные авторские рукописи, редкие издания, аудиозаписи, пластинки. Фонд изобразительного искусства представлен работами представителей отечественной художественной школы, среди которых Иван Айвазовский, Валентин Серов, Михаил Врубель, Константин Коровин.
Особого внимания заслуживает Государственная коллекция уникальных музыкальных инструментов РФ. Она была собрана при содействии Анатолия Луначарского в 1919 году. Крупнейшая в мире государственная коллекция объединяет 286 инструментов, созданных с XVI по XX век лучшими мастерами, среди которых Антонио Страдивари, Андреа Гварнери, Иван Краснощеков. Тридцать инструментов являются эталонами мирового музыкального наследия.
В музее проходит множество концертов, экскурсий, детских интерактивных занятий, выставочных проектов.
В состав Российского национального музея музыки входят:
- Музей музыки (ул. Фадеева, 4);
- Музей С.С. Прокофьева (ул. Большая Дмитровка, д. 5/6, стр. 3) - вход с Камергерского пер.;
- Мемориальная усадьба Ф.И. Шаляпина (Новинский б-р, 25–27) - находится на реставрации;
- Музей «П.И. Чайковский и Москва» (Кудринская пл., 46/54);
- Музей-квартира Н.С. Голованова (Брюсов переулок, дом 7, кв. 10);
- Музей-квартира А.Б. Гольденвейзера (Тверская ул., 17, кв. 109-110).
